Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms