Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PbsnO08976 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PbsnO08976 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PbsnO08976 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms