Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm6401L7N2C0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm6401L7N2C0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6401L7N2C0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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