Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm20878L7N244 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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