Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8356J3QPD3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms