Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20795J3QP49 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20795J3QP49 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20795J3QP49 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20795J3QP49 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20795J3QP49 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20795J3QP49 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20795J3QP49 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20795J3QP49 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20795J3QP49 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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