Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21900J3QP38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms