Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms