Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp9yF8VPU6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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