Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Gm28038F7BCN9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm28038F7BCN9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28038F7BCN9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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