Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Herc6F2Z461 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc6F2Z461 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms