Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrdnE9Q9K5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms