Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5407E9Q7Q1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5407E9Q7Q1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5407E9Q7Q1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5407E9Q7Q1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5407E9Q7Q1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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