Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Simc1E9Q6E9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Simc1E9Q6E9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms