Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms