Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms