Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Ccdc171E9Q1U1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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