Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9008E9PVG0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms