Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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9330159F19RikD3Z623 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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9330159F19RikD3Z623 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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9330159F19RikD3Z623 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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9330159F19RikD3Z623 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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9330159F19RikD3Z623 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9330159F19RikD3Z623 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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9330159F19RikD3Z623 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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9330159F19RikD3Z623 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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9330159F19RikD3Z623 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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9330159F19RikD3Z623 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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9330159F19RikD3Z623 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9330159F19RikD3Z623 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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9330159F19RikD3Z623 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms