Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-2D3Z4R4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-2D3Z4R4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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