Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms