Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms