Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms