Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smok3bC0HKC9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms