Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms