Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms