Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm436B1AVU6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms