Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NhsB1AV60 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms