Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll11A4Q9F4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms