Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms