Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm6880A3KG45 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm6880A3KG45 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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