Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atp8b5A3FIN4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atp8b5A3FIN4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atp8b5A3FIN4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Atp8b5A3FIN4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b5A3FIN4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b5A3FIN4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b5A3FIN4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b5A3FIN4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b5A3FIN4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
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Atp8b5A3FIN4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Atp8b5A3FIN4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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Atp8b5A3FIN4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms