Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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