Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd1A2AKB4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms