Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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