Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul4bA2A432 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul4bA2A432 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms