Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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