Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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