Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms