Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms