Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TCIRG1Q13488 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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