Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN3Q13064 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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