Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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