Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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