Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CCDC88CQ9P219 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CCDC88CQ9P219 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CCDC88CQ9P219 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CCDC88CQ9P219 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CCDC88CQ9P219 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC88CQ9P219 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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