Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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