Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms