Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAM2Q15035 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms