Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
TCOF1Q13428 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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