Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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